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冯柳宾 1 anno fa
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@@ -39,3 +39,15 @@ NMR Chemical Shifts of Emerging Green Solvents, Acids, and Bases for Facile Trac
 **我的考虑就是用量化计算(不同溶剂模型)这些化合物的氢谱和碳谱,然后拟合修正,看看是否经过溶剂拟合修正,可以得到更好的计算核磁数据。这是一个探索性的问题,值得做。
 **
 
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+# 小分子耦合常数计算
+
+### 预测耦合常数
+
+- Prediction of spin–spin coupling constants with machine learning in NMR https://chemistry-europe.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ansa.202000180 和 https://medium.com/@liztersahakyan/predicting-scalar-coupling-constants-using-machine-learning-c213af14e862 这个网站都是用ML预测小分子的耦合常数,都是使用https://www.kaggle.com/competitions/champs-scalar-coupling/leaderboard?tab=public 上面的数据集来做的预测。
+
+kaggle有一个耦合常数预测的竞赛,The train dataset contained 4,658,147 scalar coupling observations of 85,003 unique molecules, and the test dataset contained 2,505,542 scalar coupling observations of 45,772 unique molecules。我也可以试试用这个来练练机器学习。
+
+**我的想法,如果可以同时预测化学位移和耦合常数,那么我就可以对小分子进行全谱预测了。**
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+我的思路:先对分子进行构建,rdkit,然后进行构象寻找,可以用前面提到的方法,然后能量优化,找到能量最低的几个构象,进行boltzmann平均化处理。用这个平均化的作为描述符来预测。因为液体核磁的数据总体上是一个构象平均的结果。