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安装核磁数据处理软件

前言

后面“核磁共振谱写分析”的实验,你将会亲自操作核磁谱仪,并且获得核磁数据。而这些数据需要用专门的核磁数据处理软件才能够进行==谱图变换==,==寻峰==,==谱峰积分==等等操作。厦大化院目前有9台核磁谱仪,其中8台是Bruker核磁谱仪,1台是中科牛津谱仪。有8台谱仪是完全开放,其中7台是液体核磁(3台400MHz核磁,2台500MHz核磁,1台600MHz核磁,1台850MHz核磁),还有1台固体400MHz核磁。除了中科牛津谱仪,其他所有数据都是Bruker核磁谱仪数据格式,当然中科牛津数据也可以转换为Bruker数据格式。所以后面我们主要是说明Bruker数据格式的处理。

核磁处理软件列表

以下列出目前用得比较多的核磁数据处理软件,其中我们主要是推荐Bruker公司的Topspin 4.x版本。

  • Topspin 目前有提供学术免费版本。我建议学术注册账号,下载该软件进行安装(后面我会详细列出具体安装操作)。
  • MNOVA 该软件具有较好的出图效果,可以绘制更加漂亮的谱图;但是并没有免费版本,有30天试用版本。
  • ACDNMR 也是不错的谱图处理软件,不仅有NMR也可以处理MS和IR等。但是也是商业软件,有60天试用版本。
  • NMRPipematNMR 完全开源免费版本,但是安装操作比较麻烦,出图效果不是很好。如果你会试用Python,也可以尝试用库nmrglue读取原始数据进行谱图变换,然后用matplotlib等出图。
  • NMRIUM 开源免费网页版本,如果你实在安装不了上面的软件,可以打开这个网页进行一维和二维的核磁数据处理。

Topspin 安装

  1. 打开布鲁克官网页面,注册并登录(注意要用xmu.edu.cn结尾的邮箱,并且最好用校园网登录,要不然可能出现审核不通过),需要等待对方审核账号才能够用,正常不会太久。

  1. 找到合适的版本进行下载(推荐使用最新版本4.x以上版本),如果下载比较慢,可以使用我已经下载的链接http://biotool.xmu.edu.cn/media/topspin-4.1.3.exe

  1. 下载到本地双击打开,按照提示安装,一直next,直到全部完成,显示Finish。

  1. 打开安装好的软件,显示如下:

点击“Request a free Academic License”

  1. 登录刚才注册的网页,然后产生一个学术版本的License。

点击红框所示,生成如下图所示代码:

将该代码复制后回到topspin软件打开的界面里面的“Install License ticket”。

考入刚才那个代码,点击Next,出现如下所示界面:

点击激活许可后出现如下界面,选择绑定方式为存于当前电脑并激活:

  1. 重新打开软件,点击I Accept, Do Not Show License Again后点击Expinstall安装实验模板等信息(或是在命令行输入expinstall安装)。注意输入的密码为安装软件时的密码。安装完毕点击close即可

注脚:很多内容拷贝于布鲁克磁共振微博